Puisque tu n'es pas en RAID1, c'est "foutu" pour le volume Systeme et les App qui sont dessus.
Cependant cela ne doit pas affecter les données présente sur les autres volumes ( c'est un peu le but d'avoir la séparation des volumes ), cependant puisqu'l s'agit du volume systeme cela peut rendre QTS un peu instable. Si tu redémarre sans SSD, il devrait basculer le "systeme" sur le 1er volume dispo.
Si tu reprend 2 SSD, tout n'est pas a reprendre a 0, les autres volumes ne sont pas impactés, ni la configuration du NAS, mais les applications, ... oui